我是一个新的paramiko用户,并且很难在paramiko的远程服务器上运行命令.我想导出一个路径,并在后台运行一个名为tophat的程序.我可以使用paramiko.sshclient()登录,但我的exec_command代码没有结果.
stdin,stdout,sterr = ssh.exec_command('export PATH=$PATH:/proj/genome/programs
/tophat-1.3.0/bin:/proj/genome/programs/cufflinks-1.0.3/bin:/proj/genome/programs/
bowtie-0.12.7:/proj/genome/programs/samtools-0.1.16')
stdin,sterr = ssh.exec_command('nohup tophat -o /output/path/directory -I
10000 -p 8 --microexon-search -r 50 /proj/genome/programs/bowtie-0.12.7/indexes
/ce9 /input/path/1 /input/path/2 &')
没有nohup.out文件,python只是转到下一行,没有错误消息.我也试过没有nohup,结果是一样的.我试图遵循this paramiko tutorial.
我是否正确使用exec_command？
解决方法
我也遇到了同样的问题,在查看了
this article和
this answer之后,我看到解决方案是调用Channel的recv_exit_status()方法.这是我的代码：
import paramiko
import time
cli = paramiko.client.SSHClient()
cli.set_missing_host_key_policy(paramiko.client.AutoAddPolicy())
cli.connect(hostname="10.66.171.100",username="mapping")
stdin_,stdout_,stderr_ = cli.exec_command("ls -l ~")
# time.sleep(2) # PrevIoUsly,I had to sleep for some time.
stdout_.channel.recv_exit_status()
lines = stdout_.readlines()
for line in lines:
print line
cli.close()