R语言学习之获取数据的学习(XML和JSON文件的读取）

R中内置的数据集 R的基本分发包中有一个叫做datasets，里面全是示例数据集，使用data函数来查看你已成功加载的包的数据集

> data()

需要更完整的列表，包括以安装的所有包的数据

> data(package = .packages(TRUE))

read,tabke 函数可用于读取以空格符为分隔的文件 read.csv 函数默认设置分隔符为逗号，read.csv2默认以逗号作为小数位 skip用于跳过几行 nrow 是指定读取的行数

read.delim和read.delim2分别使用句号和小数位作为分隔符

> crab_file <- system.file("extdata","crabtag.csv",package = "learningr")
> (crab_id_block <- read.csv(crab_file,header = TRUE,skip = 3,nrows = 2))
                               Firmware.Version.No X2
1                             Firmware Build Level 70
2 The following data are the Tag notebook contents NA

crabtag.csv默认安装在extdata文件夹下

readLInes函数用来读取非结构化文本文件先读入文件中所有的文本行，再对其内容进行操作

> text_file <- system.file("extdata","Shakespeare's The Tempest,from Project Gutenberg pg2235.txt",package = "learningr")
> the_tempest <- readLines(text_file)
Warning message:
In file(con,"r") :
  file("") only supports open = "w+" and open = "w+b": using the former
> the_tempest[1926:1927]
[1] NA NA

可以读取XML文件首先安装包

> install.packages("XML")

xmLParse函数来导入XML数据

> library(XML)
> xml_file <- system.file("extdata","options.xml",package = "learningr")
> r_option <- xmlParse(xml_file)

使用内部节点的一个问题就是不能用head 和str函数，要使用R级函数的可以用以下两种方法

> xmlParse(xml_file,useInternalNodes = FALSE)
$doc
$file
[1] "E:/RsoftWare/R-3.2.2/library/learningr/extdata/options.xml"

$version
[1] "1.0"

$children
$children$root
<root>
 <variable name="add_smooth" type="character">
  <value>TRUE</value>

> xmlTreeParse(xml_file)
$doc
$file
[1] "E:/RsoftWare/R-3.2.2/library/learningr/extdata/options.xml"

$version
[1] "1.0"

$children
$children$root
<root>
 <variable name="add_smooth" type="character">
  <value>TRUE</value>
 </variable>
 <variable name="browserNLdisabled" type="character">
  <value>FALSE</value>

XPATH是用于查询XML文档的语言，过滤某些规则来寻找相应的节点，寻找variable节点，此节点[]的name属性@包含了contains了warn字符串

这是对于文件截取后也就是system,file文件操作后的文件进行操作

htmlParse 和 htmlTreeParse 适用于HTML页面导入的函数

XML包提供了序列化，即存储的功能

> library(Runiversal)
> 
> ops <- as.list(options())
> cat(makexml(ops),file = "options.xml")

我的电脑是默认存贮在D盘的文档中

JSON文件是WEB程序彼此之间传递数据的标准

两个包常用于处理JSON RJSONIO比较推荐 rjson有问题

::用于把相同名字的函数从不同的包中解析出来首先就要下载包和加载包了就不说了

> library(RJSONIO)
> library(rjson)

> city_file <- system.file("extdata","Jamaican Cities.json",package = "learningr")
> jamacia_city <- RJSONIO::fromJSON(city_file)

RJSON把每个城市的坐标都转化为向量，可以通过simplify = false 来关闭，产生的数据和rjson一样

RJSONIO把NAN和NA映射为JSON的null,但保留正负无穷rjson把这些值转化为字符串

yaml包常用于处理特殊数字类型 as,yaml则用于把R对象转化为YAML字符串

http://www.biostatistic.net/thread-74482-1-1.html 具体可以看这个文章有关各个参数的解析

> special <- c(NaN,NA,Inf,-Inf)
Warning message:
closing unused connection 3 () 
> special
[1]  NaN   NA  Inf -Inf
> RJSONIO::toJSON(special)
[1] "[ null,null,Infinity,- Infinity ]"
Warning message:
In .local(x,container,collapse,...,.level = .level,.withNames = .withNames,:
  non-fininte values in numeric vector may not be approriately represented in JSON
> rjson::toJSON(special)
[1] "[\"NaN\",\"NA\",\"Inf\",\"-Inf\"]"

R语言学习之获取数据的学习(XML和JSON文件的读取）

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