到目前为止,我有这个错误;
Configuration error: could not find the MysqL installation include and/or library directories. Manually specify the location of the MysqL libraries and the header files and re-run R CMD INSTALL. INSTRUCTIONS: 1. Define and export the 2 shell variables PKG_CPPFLAGS and PKG_LIBS to include the directory for header files (*.h) and libraries,for example (using Bourne shell Syntax): export PKG_CPPFLAGS="-I<MysqL-include-dir>" export PKG_LIBS="-L<MysqL-lib-dir> -lMysqLclient" Re-run the R INSTALL command: R CMD INSTALL RMysqL_<version>.tar.gz 2. Alternatively,you may pass the configure arguments --with-MysqL-dir=<base-dir> (distribution directory) or --with-MysqL-inc=<base-inc> (where MysqL header files reside) --with-MysqL-lib=<base-lib> (where MysqL libraries reside) in the call to R INSTALL --configure-args='...' R CMD INSTALL --configure-args='--with-MysqL-dir=DIR' RMysqL_<version>.tar.gz ERROR: configuration Failed for package ‘RMysqL’ * removing ‘/home/samuel/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RMysqL’ Warning in install.packages : installation of package ‘./RMysqL_0.9-3.tar.gz’ had non-zero exit status
所以我按照1所说的说法.
我输入
export PKG_CPPFLAGS="-I</usr/include/MysqL>" export PKG_LIBS="-L</usr/lib/MysqL> -lMysqLclient"
然后再次尝试在终端上安装他们给我的命令
R CMD INSTALL RMysqL_<version>.tar.gz
而我得到;
checking for unistd.h... yes checking MysqL.h usability... no checking MysqL.h presence... no checking for MysqL.h... no configure: creating ./config.status config.status: creating src/Makevars ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I</usr/include/MysqL> -fpic -O3 -pipe -g -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I</usr/include/MysqL> -fpic -O3 -pipe -g -c RS-MysqL.c -o RS-MysqL.o In file included from RS-MysqL.c:22:0: RS-MysqL.h:32:19: fatal error: MysqL.h: No existe el archivo o el directorio #include <MysqL.h> ^ compilation terminated. make: *** [RS-MysqL.o] Error 1 ERROR: compilation Failed for package ‘RMysqL’
所以抬头我发现了这个建议;
installing RMySQL gives error RS-MySQL.h:32:19: fatal error: mysql.h: No such file
并遵循它在这里所说的:
http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL
我没有这一步;
3.编辑或创建文件Renviron.site并添加包含MysqL安装位置的变量MysqL_HOME.安装R时通常不会创建该文件,因此您可能需要自己创建.您需要将它放在R Home区域的/ etc目录下.如果您不知道它在哪里,可以在R提示符下发出R.home().您将在variable = value语法中添加名为MysqL_HOME的变量.这是一个例子:
Renviron.site的位置:C:/PROGRA~1/R/R-2.11〜1.0/etc/Renviron.site
内容是:
MysqL_HOME = C:/PROGRA~1/MysqL/MysqLS~1.0/
因为,当我在Renviron.site中,它不会让我编辑任何东西,我也不清楚我应该放在那里,无论如何,我写
MysqL_HOME=C:/PROGRA~1/MysqL/MysqLS~1.0/***
但我不能保存它,它不会让我,因为它说我不允许,我不能在/ etc /中创建一个新文件或任何东西
你的输入是错误的,首先要摆脱大于和小于标志.然后为MysqL include目录运行命令:
$MysqL_config --include
如果它与您已经提供的路径相同而不是:
export PKG_CPPFLAGS="-I</usr/include/MysqL>"
输入:
export PKG_CPPFLAGS="-I/usr/include/MysqL"
对于库路径输入命令:
$MysqL_config --libs
和上面一样进入路径没有我的标志就像是:
export PKG_LIBS="-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lMysqLclient"
最后在最后一个输入而不是“版本”中指定版本号.这些步骤可以解决您的问题.要在/ etc /目录中进行编辑和编写,您应具有权限,如果您是管理员,则可以通过sudo命令执行此操作.而且你提供的路径是windows而不是linux.