如何使用自动增量主键将数据从R写入PostgreSQL表?

前端之家收集整理的这篇文章主要介绍了如何使用自动增量主键将数据从R写入PostgreSQL表?前端之家小编觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
我在Postgresql数据库中有一个表,它有一个BIGSERIAL自动递增主键.使用以下方法重新创建
CREATE TABLE foo
(
  "Id" bigserial PRIMARY KEY,"SomeData" text NOT NULL
);

我想通过RPostgresql包从R向该表附加一些数据.在R中,数据不包括Id列,因为我希望数据库生成这些值.

dfr <- data.frame(SomeData = letters)

这是我用来尝试编写数据的代码

library(RPostgresql)
conn <- dbConnect(
  "Postgresql",user     = "yourname",password = "your password",dbname   = "test"
)
dbWriteTable(conn,"foo",dfr,append = TRUE,row.names = FALSE)
dbDisconnect(conn)

不幸的是,dbWriteTable抛出一个错误

## Error in postgresqlgetResult(new.con) : 
##   RS-DBI driver: (could not Retrieve the result : ERROR:  invalid input Syntax for integer: "a"
## CONTEXT:  COPY foo,line 1,column Id: "a"
## )

错误消息并不完全清楚,但我将其解释为R试图将SomeData列的内容传递给数据库中的第一列(即Id).

我应该如何将数据传递给Postgresql,以便自动生成Id列?

从hrbrmstr评论中的帖子中,我找到了 a hack来完成这项工作.

在RPostgresql包中的postgresqlWriteTable中,您需要替换该行

sql4 <- paste("COPY",postgresqlTableRef(name),"FROM STDIN")

sql4 <- paste(
  "COPY ","(",paste(postgresqlQuoteId(names(value)),collapse = ","),") FROM STDIN"
)

请注意,引用变量(未包含在原始hack中)对于传递区分大小写的列名称是必需的.

这是一个脚本:

body_lines <- deparse(body(RPostgresql::postgresqlWriteTable))
new_body_lines <- sub(
  'postgresqlTableRef(name),"FROM STDIN")','postgresqlTableRef(name),paste(shQuote(names(value)),") FROM STDIN")',body_lines,fixed = TRUE
)
fn <- RPostgresql::postgresqlWriteTable
body(fn) <- parse(text = new_body_lines)
while("RPostgresql" %in% search()) detach("package:RPostgresql")
assignInNamespace("postgresqlWriteTable",fn,"RPostgresql")

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