软件系统的“组织设置”必须以业务流程运作为核心，要求尽可能简单并保持相对稳定，在公司（人员）规模扩大的过程中具有延续性与继承性。
ORACLE EBS系统组织划分为“业务组（Business Group）、法律实体（Legal Entity）、业务实体（Operating Unit）、库存组织（Inventory Org）”等，与企业实际的行政组织不是完全等同的概念，而是基于系统业务运作需要而设定的。

业务组（BG，Business Group）

“业务组”的概念可以视同企业的“集团”概念，但不同的是一个企业在系统中可以设置多个“业务组（集团）”。
通常对于一个企业来说，系统中有一个“业务组”就够了，这表示企业就是一个“集团公司”。而对于某些业务“多元化”的特大型公司（如跨国公司），则可能需要在系统中设置多个“业务组”，表示企业由多个“集团公司”组成。
业务组设置是系统组织设置的第一步，是最高层级的组织形态，但它主要是与人力资源信息的分隔有关，即“人员信息”的设置在一个BG范围内是由各业务模块共享的（如果需要）。一旦系统设置的用户名（User）被与“人员”（Employee）关联，无论使用什么“责任”进入系统，都会定位至一个确定的BG中，任何责任在任意时刻只能关联一个BG。EBS安装好后，系统里面已经预置了一个名为“Setup Business Group”的“初始业务组”。

法律实体（LE，Legal Entity）

对应实际的按国家法律法规注册的法人公司。
R12中在定义“分类帐”时的“会计科目设置管理器”WEB中定义并分配法人实体LE。一个分类帐设置（主辅分类帐）可以添加多个LE，但每个LE只能具有一个分类帐设置。
业务实体（OU，Operating Unit）是EBS系统组织设置的重点也是难点之一。它与法人主体LE本身没有必然的关系，与会计科目弹性域结构中的“公司段”也没有直接关系。
从企业实际业务管理需要的角度去看，业务实体OU可以看作是在系统中按照业务的相似性，把多个不同公司（包括LE）的业务处理过程及数据划分成相对独立的“管理单元”。在每个管理单元内部，各公司的业务运作共享相关数据并执行统一的业务策略。

库存组织（Inventory Org）

不是真实业务的“仓库管理部门”那么简单，它除了是有“物料接收与发出”等业务功能之外，更重要的是，它还是EBS系统有关计划（MPS主生产计划/MRP物料需求计划）、在制品管理（WIP）、物料清单（BOM）等模块业务功能的操作与管理平台。
在EBS中还有两个组织概念“MRP组织、WIP组织”，它们实际是必须构建于库存组织之上的组织概念，表示该库存组织还可以进行MRP或WIP的功能。系统之所以如此处理，主要是为了控制某些INV不能做MRP或WIP而已，因为基于物料接收或发出需要所设定的INV数量可能比较多。
对于绝大多数基于库存组织INV的业务功能（个别除外），系统用户在做业务操作时，均必须首先进行INV的选择切换，以便进入确定的INV上下文环境。库存组织的作用是如此基础，以至于EBS的相关文档在提及组织（Org）概念时，如果未作特别说明，默认就是指INV组织。
一个库存组织INV只能属于一个确定的帐套SOB、一个确定的法人实体LE、一个确定的业务实体OU。反之，一个“帐套/法人实体/业务实体”组合则可以有多个库存组织INV。

HR组织

系统的HR组织设置是与HRM模块的相关业务处理功能相关，与核心业务、财务处理功能关系不大

资产组织

“资产组织”的设置，它是在企业需使用到资产管理模块FA时才涉及到。“资产组织”实际上是所谓“资产账簿”的代名词，它只是表示有关资产信息的一个数据维度，作用主要在于分隔数据范围

多组织访问控制

EBS组织设置界面中，所谓的组织“类型”（Type）划分仅是基于组织自身的统计分析工作需要而定义的一个“维度”，例如“公司总部、产品线”等等，并不影响系统的业务处理功能。真正起作用的是设置界面中的“组织分类”，系统预置的组织分类LOV除了上述“业务组、法律实体、业务实体、库存组织”等之外，还有诸如“资产组织、运营公司、雇主”等等选项。在EBS系统中各应用模块所具有的业务处理功能通常需构建在一个确定的“组织分类”之上，“组织”是相关业务处理功能的平台，企业是否需要作相关组织分类设置、如何设置，取决于企业所需要使用到的应用模块功能。
ORACLR系统通过“组织”所具有的“层次结构”（Hierarchy）概念来达到“多组织访问”权限的控制功能。
这里的组织“层次结构”与真实企业的行政管理组织层次结构没有直接关系（尽管可能有所参考），它只是企业根据某种需要（如权限管理控制、数据统计汇报等）而人为设定的一个“层次结构”，例如将系统中已经设置的任意数量的“业务实体”或“库存组织”等组织，人为地设定一个具有上下级关系、自顶向下的金字塔形多层结构。

配置文件

所有定义的“安全性配置文件”构成系统多组织接入控制参数“MO：安全性配置文件”的LOV EBS 通过“MO：业务实体”、“MO：安全性配置文件”、“MO：默认业务实体”这三个系统配置文件的共同作用，实现所谓“多组织访问”控制功能。 对于“MO：业务实体”：在R12中， 一旦设定“MO：安全性配置文件”，则此配置文件失效而不起作用。 对于“MO：安全性配置文件”，：在R12中，该参数如果不设定，则必须设定“MO：业务实体”参数；一旦该参数被设定，则就起决定作用，系统主要依赖其实现“多组织访问”控制功能。 对于“MO：默认业务实体”： 在R12中，随“MO：安全配置文件”起作用后才起作用，其LOV是所有已定义OU，但如果设定值不在“MO：安全配置文件”所选择的“组织层次架构”的范围内，则仍不起作用（即在与OU相关诸如PO、OM等的FORM界面，OU字段的默认值仍然为空）。 ORACLE强调其“多组织接入MOAC”功能主要是针对业务实体OU而言。库存组织的访问是在“组织访问”控制功能中，专门设定“库存组织”与“责任”的关联性 。 EBS系统通过“弹性域段值安全性”、“帐套/分类帐安全性”、“多组织访问控制（MOAC）”、“库存组织访问控制”等多维度、多方面的组合系统设置，提供了灵活、方便的用户权限管理功能，理清并掌握它们的复杂关系是系统实施的一项重要基础性工作。