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http://blog.fens.me/nosql-r-mongodb/

2. rmongodb函数库

文字说明部分：

rmongodb的开发了一大堆的函数，对应mongo的操作。比起别的Nosql来说，真是工程浩大啊。但我总觉得封装粒度不够，写起代码来比较复杂。

下面列出了所有rmongodb函数库，我只挑选几个常用的介绍。

建立mongo连接

mongo<-mongo.create()

查看接连是否正常

mongo.is.connected(mongo)

创建一个BSON对象缓存

buf <- mongo.bson.buffer.create()

给对象buf增加element

mongo.bson.buffer.append(buf,"name","Echo")

增加对象类型的element

score <- c(5,3.5,4)
names(score) <- c("Mike","Jimmy","Ann")
mongo.bson.buffer.append(buf,"score",score)

增加数组类型的element

mongo.bson.buffer.start.array(buf,"comments")
mongo.bson.buffer.append(buf,"0","a1")
mongo.bson.buffer.append(buf,"1","a2")
mongo.bson.buffer.append(buf,"2","a3")

关闭数组类型的element

mongo.bson.buffer.finish.object(buf)

取出缓存数据

b <- mongo.bson.from.buffer(buf)

数据库.数据集

ns="db.blog"

插入一条记录

mongo.insert(mongo,ns,b)

#mongo shell:(Not Run)
db.blog.insert(b)

创建查询对象query

buf <- mongo.bson.buffer.create()
mongo.bson.buffer.append(buf,"Echo")
query <- mongo.bson.from.buffer(buf)

创建查询返回值对象

 执行单条记录查询
 
mongo.find.one(mongo,query,fields)

#mongo shell:(Not Run)
db.blog.findOne({query},{fields})
 
 执行列表记录查询
 
mongo.find(mongo,fields)

#mongo shell:(Not Run)
db.blog.find({query},79); font-size:13px; line-height:20px"> 创建修改器对象objNew
 
buf <- mongo.bson.buffer.create()
mongo.bson.buffer.start.object(buf,"$inc")
mongo.bson.buffer.append(buf,"age",1L)
mongo.bson.buffer.finish.object(buf)
objNew <- mongo.bson.from.buffer(buf)
 
 执行修改操作
 
mongo.update(mongo,objNew)

#mongo shell:(Not Run)
db.blog.update({query},{objNew})
 
 单行代码修改操作
 
 删除所选对象
 
mongo.remove(mongo,query)

#mongo shell:(Not Run)
db.blog.remove({query},79); font-size:13px; line-height:20px"> 销毁mongo连接
 
mongo.destroy(mongo)
 
 代码部分：
 
 共有153个函数
 
mongo.add.user
mongo.authenticate
mongo.binary.binary
mongo.binary.function
mongo.binary.md5
mongo.binary.old
mongo.binary.user
mongo.binary.uuid
mongo.bson.array
mongo.bson.binary
mongo.bson.bool
mongo.bson.buffer.append
mongo.bson.buffer.append.bool
mongo.bson.buffer.append.bson
mongo.bson.buffer.append.code
mongo.bson.buffer.append.code.w.scope
mongo.bson.buffer.append.complex
mongo.bson.buffer.append.double
mongo.bson.buffer.append.element
mongo.bson.buffer.append.int
mongo.bson.buffer.append.list
mongo.bson.buffer.append.long
mongo.bson.buffer.append.null
mongo.bson.buffer.append.object
mongo.bson.buffer.append.oid
mongo.bson.buffer.append.raw
mongo.bson.buffer.append.regex
mongo.bson.buffer.append.string
mongo.bson.buffer.append.symbol
mongo.bson.buffer.append.time
mongo.bson.buffer.append.timestamp
mongo.bson.buffer.append.undefined
mongo.bson.buffer.create
mongo.bson.buffer.finish.object
mongo.bson.buffer.size
mongo.bson.buffer.start.array
mongo.bson.buffer.start.object
mongo.bson.code
mongo.bson.code.w.scope
mongo.bson.date
mongo.bson.dbref
mongo.bson.destroy
mongo.bson.double
mongo.bson.empty
mongo.bson.eoo
mongo.bson.find
mongo.bson.from.buffer
mongo.bson.from.list
mongo.bson.int
mongo.bson.iterator.create
mongo.bson.iterator.key
mongo.bson.iterator.next
mongo.bson.iterator.type
mongo.bson.iterator.value
mongo.bson.long
mongo.bson.null
mongo.bson.object
mongo.bson.oid
mongo.bson.print
mongo.bson.regex
mongo.bson.size
mongo.bson.string
mongo.bson.symbol
mongo.bson.timestamp
mongo.bson.to.list
mongo.bson.undefined
mongo.bson.value
mongo.code.create
mongo.code.w.scope.create
mongo.command
mongo.count
mongo.create
mongo.cursor.destroy
mongo.cursor.next
mongo.cursor.value
mongo.destroy
mongo.disconnect
mongo.distinct
mongo.drop
mongo.drop.database
mongo.find
mongo.find.await.data
mongo.find.cursor.tailable
mongo.find.exhaust
mongo.find.no.cursor.timeout
mongo.find.one
mongo.find.oplog.replay
mongo.find.partial.results
mongo.find.slave.ok
mongo.get.database.collections
mongo.get.databases
mongo.get.err
mongo.get.hosts
mongo.get.last.err
mongo.get.prev.err
mongo.get.primary
mongo.get.server.err
mongo.get.server.err.string
mongo.get.socket
mongo.get.timeout
mongo.gridfile.destroy
mongo.gridfile.get.chunk
mongo.gridfile.get.chunk.count
mongo.gridfile.get.chunks
mongo.gridfile.get.chunk.size
mongo.gridfile.get.content.type
mongo.gridfile.get.descriptor
mongo.gridfile.get.filename
mongo.gridfile.get.length
mongo.gridfile.get.md5
mongo.gridfile.get.Metadata
mongo.gridfile.get.upload.date
mongo.gridfile.pipe
mongo.gridfile.read
mongo.gridfile.seek
mongo.gridfile.writer.create
mongo.gridfile.writer.finish
mongo.gridfile.writer.write
mongo.gridfs.create
mongo.gridfs.destroy
mongo.gridfs.find
mongo.gridfs.remove.file
mongo.gridfs.store
mongo.gridfs.store.file
mongo.index.background
mongo.index.create
mongo.index.drop.dups
mongo.index.sparse
mongo.index.unique
mongo.insert
mongo.insert.batch
mongo.is.connected
mongo.is.master
mongo.oid.create
mongo.oid.from.string
mongo.oid.print
mongo.oid.time
mongo.oid.to.string
mongo.reconnect
mongo.regex.create
mongo.remove
mongo.rename
mongo.reset.err
mongo.set.timeout
mongo.shorthand
mongo.simple.command
mongo.symbol.create
mongo.timestamp.create
mongo.undefined.create
mongo.update
mongo.update.basic
mongo.update.multi
mongo.update.upsert
 
 3. rmongodb基本使用操作
 
 首先，要安装rmongodb类库，加载类库。
 
 然后，通过mongo.create()函数，建立与MongoDB Server的连接。如果是本地连接，mongo.create()不要参数，下面例子使用远程连接，增加host参数配置IP地址。mongo<-mongo.create(host=“192.168.1.11”)
 
 检查是否连接正常，mongo.is.connected()。这条语句在开发时会经常使用到。在用R语言建模时，如果对象或者函数使用错误，连接会被自动断开。由于MongoDB的异常机制，断开时不会是提示。大家要手动使用这条命令测试，连接是否正常。
 
 接下来，定义两个变量，db和ns。db是我们需要使用的数据库，ns是数据库+数据集。
 
 下面我们创建一个Mongo对象。
 
{
        "_id" : ObjectId("51663e14da2c51b1e8bc62eb"),"name" : "Echo","age" : 22,"gender" : "Male","score" : {
                "Mike" : 5,"Jimmy" : 3.5,"Ann" : 4
        },"comments" : [
                "a1","a2","a3"
        ]
}
 
 然后，分别使用修改器$inc,$set,$push进行操作。
 
 最后删除对象，并断开连接。
 
 代码部分：
 
 安装rmongodb
 
install.packages(rmongodb)
 
 加载类库
 
library(rmongodb)
 
 远程连接mongodb server
 
mongo<-mongo.create(host="192.168.1.11")
 
 查看是否连接正常
 
print(mongo.is.connected(mongo))
 
 定义db
 
db<-"foobar"
 
 定义db.collection
 
ns<-"foobar.blog"
 
 组织bson类型数据
 
score <- c(5,score)

#数组类型
mongo.bson.buffer.start.array(buf,"a3")
mongo.bson.buffer.finish.object(buf)
b <- mongo.bson.from.buffer(buf)
 
 插入mongodb
 
 单条显示插入的数据
 
 
 使用$inc修改器，修改给age加1
 
 使用$set修改器，修改age=1
 
 使用$push修改器，给comments数组追加”Orange”数据
 
 使用简化修改语句，给对象重新赋值
 
 删除对象
 
mongo.destroy(mongo)
 
 4. rmongodb测试案例
 
 批量插入数据，使用修改器批量修改数据
 
 3种修改器速度比较,$push最慢
 $push > $set > $inc
 
 终于push是对数组操作，set是对任意值操作，inc是对数字操作，所以下面测试可能不太公平。测试结果仅供参考。
 
 批量插入数据函数
 
batch_insert<-function(arr=1:10,ns){
    library(stringr)
    mongo_insert<-function(x){
      buf <- mongo.bson.buffer.create()
      mongo.bson.buffer.append(buf,str_c("Dave",x))
      mongo.bson.buffer.append(buf,x)
      mongo.bson.buffer.start.array(buf,"comments")
      mongo.bson.buffer.append(buf,"a1")
      mongo.bson.buffer.append(buf,"a2")
      mongo.bson.buffer.append(buf,"a3")
      mongo.bson.buffer.finish.object(buf)
      return(mongo.bson.from.buffer(buf))
    }
    mongo.insert.batch(mongo,lapply(arr,mongo_insert))
  }
 
 批量修改，$inc修改器函数
 
batch_inc<-function(data,ns){
    for(i in data){
      buf <- mongo.bson.buffer.create()
      mongo.bson.buffer.append(buf,i))
      criteria <- mongo.bson.from.buffer(buf)
      buf <- mongo.bson.buffer.create()
      mongo.bson.buffer.start.object(buf,"$inc")
      mongo.bson.buffer.append(buf,1L)
      mongo.bson.buffer.finish.object(buf)
      objNew <- mongo.bson.from.buffer(buf)
      mongo.update(mongo,criteria,objNew)
    }
  }
 
 批量修改，$set修改器函数
 
batch_set<-function(data,"$set")
      mongo.bson.buffer.append(buf,79); font-size:13px; line-height:20px"> 批量修改，$push修改器函数
 
batch_push<-function(data,"$push")
      mongo.bson.buffer.append(buf,"Orange")
      mongo.bson.buffer.finish.object(buf)
      objNew <- mongo.bson.from.buffer(buf)
      mongo.update(mongo,79); font-size:13px; line-height:20px"> 执行程序，3种修改速度比较,$push最慢
 
ns="foobar.blog"
  data=1:1000

  mongo.remove(mongo,ns)
  ## [1] TRUE

  system.time(batch_insert(data,ns))
  ##    user  system elapsed 
  ##    0.25    0.00    0.28 

  system.time(batch_inc(data,ns))
  ##    user  system elapsed 
  ##    0.47    0.27    2.50 

  system.time(batch_set(data,ns))
  ##    user  system elapsed 
  ##    0.77    0.48    3.17 

  system.time(batch_push(data,ns))
  ##    user  system elapsed 
  ##    0.81    0.41    4.23