我是R的新手,但有兴趣使用Shiny使用存储在sql Server数据库中的数据创建动态图表.为了实现交互性,我想从数据库中引入原始数据,并在R中执行计算,而不是让数据库总结数据.
我可以使用RODBC连接到数据库,执行查询,并在data.frame中接收结果.但是,R中的读取时间比在sql Server Management Studio(SSMS)中执行的相同查询长约12倍. SSMS需要大约600 ms,而R需要大约7.6秒.我的问题是我是否做错了事情,还是R数据库访问真的很慢？如果是,是否有更快的选择(例如将数据库输出写入文件并阅读文件)？
有关查询的一些信息可能有帮助：查询检索大约250K行与4列.第一列是日期,其他三个是数值.运行R和SSMS的机器是具有32GB内存的高端Win 7工作站.我正在运行的R命令是：
system.time(df <- sqlQuery(cn,query))
返回：
user system elapsed 7.17 0.01 7.58
有趣的是,从sql到我的机器的数据传输看起来很快,但是R在返回数据框之前在内部忙着做几秒钟.我看到这是因为网络利用率在第一秒钟尖峰,几乎立即返回到接近0.然后几秒钟后,R data.frame返回.
解决方法
我会尝试RJDBC
http://cran.r-project.org/web/packages/RJDBC/RJDBC.pdf
http://cran.r-project.org/web/packages/RJDBC/RJDBC.pdf
与这些驱动程序https://msdn.microsoft.com/en-us/sqlserver/aa937724.aspx
library(RJDBC)
drv <- JDBC("com.microsoft.sqlserver.jdbc.sqlServerDriver","/sqljdbc4.jar")
con <- dbConnect(drv,"jdbc:sqlserver://server.location","username","password")
dbGetQuery(con,"select column_name from table")
