sql – 如何处理r语言中的50GB大型csv文件？

我在这里的“大数据流程”中比较新,希望能找到一些关于如何处理50 GB csv文件的建议.目前的问题如下：

表看起来像：

ID,Address,City,States,... (50 more fields of characteristics of a house)
1,1,1st street,Chicago,IL,...
# the first 1 is caused by write.csv,they created an index raw in the file

我想找到属于加利福尼亚州旧金山的所有行.它应该是一个简单的问题,但csv太大了.

我知道我有两种方法在R中执行它,另一种方法是使用数据库来处理它：

(1)使用R的ffdf包：

自上次保存文件以来,它使用的是write.csv,它包含所有不同的类型.

all <- read.csv.ffdf(
  file="<path of large file>",sep = ",",header=TRUE,VERBOSE=TRUE,first.rows=10000,next.rows=50000,)

控制台给了我这个：

Error in ff(initdata = initdata,length = length,levels = levels,ordered = ordered,: vmode 'character' not implemented

通过在线搜索,我找到了几个不适合我的案例的答案,我无法理解如何将“字符”转换为他们提到的“因素”类型.

然后我尝试使用read.table.ffdf,这更是灾难.我找不到那个坚实的指南.

(2)使用R的readline：

我知道这是另一种好方法,但找不到有效的方法来做到这一点.

(3)使用sql：

我不知道如何将文件传输到sql版本,以及如何处理这个,如果有一个很好的指南我想尝试.但总的来说,我想坚持使用R.

感谢您的回复和帮助！

解决方法

您可以使用sqtf包在窗帘后面使用R和sqlite.您将使用sqldf包中的read.csv.sql 函数,然后您可以查询数据,但是您希望获得较小的数据框.

来自文档的示例：

library(sqldf)

iris2 <- read.csv.sql("iris.csv",sql = "select * from file where Species = 'setosa' ")

我已经在非常大的CSV文件上使用了这个库,效果很好.

原文链接：https://www.f2er.com/mssql/76179.html

sql – 如何处理r语言中的50GB大型csv文件？

解决方法

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