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How to concatenate string variables in Bash28个
我正在尝试使用wget和url从数据库下载文件.例如.
我正在尝试使用wget和url从数据库下载文件.例如.
wget“http://www.rcsb.org/pdb/files/1BXS.pdb”
所以url的格式是这样的：http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb“
但我有很多文件需要下载;所以我写了一个bash脚本,从文本文件中读取id_numbers,形成url字符串并通过wget下载.
!/bin/bash while read line do url="http://www.rcsb.org/pdb/files/$line.pdb" echo -e $url wget $url done < id_numbers.txt
但是,url字符串形成为
.pdb://www.rcsb.org/pdb/files/4H80
所以,.pdb充满了http.我无法弄清楚为什么.有没有人有想法？
我如何格式化它以便url
"http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb"
？
非常感谢.
注意.这个问题被标记为“如何在bash中连接字符串？”的副本但我实际上是在寻求别的东西.我在问这个问题之前就已经阅读了这个问题,事实证明我的问题是在Windows中准备txt文件并不是真正的字符串.我编辑了问题标题.我希望现在更清楚了.
解决方法
听起来你的id_numbers.txt文件有DOS / Windows风格的行结尾(回车后跟换行字符)而不是普通的unix行结尾(只是换行).结果是read认为该行以回车符结束,$line实际上在末尾有一个回车符,并且嵌入在url中,导致各种混淆.
有几种方法可以解决这个问题.使用它时,您可以从变量中修改回车符：
url="http://www.rcsb.org/pdb/files/${line%$'\r'}.pdb"
或者你可以通过告诉它将回车计为空格来读取它(读取将从它读取的内容中修剪前导和尾随空格)：
while IFS=$'\r' read line
或者您可以使用dos2unix(或操作系统上的等效项)之类的命令来转换id_numbers.txt文件.
