我有一个使用treemap中的tmPlot函数的包,但是当我尝试使用该函数时,它会抛出一个错误,其中没有加载其中一个依赖项:
Error in tmPlot(data,index = index,vSize = vSize) : could not find function "brewer.pal"
依赖项已安装在命名空间中.
这个问题有一些设置,是一个包问题,但我试图尽可能减少它:
确保安装了treemap(及其所有依赖项).
我做了一个名为’anRpackage’的目录.里面是一个文件夹(‘R’)和一个带有以下文字的DESCRIPTION文件:
Package: anRpackage Title: What the package does (short line) Version: 1.0 Author: Who wrote it Maintainer: Who to complain to <yourfault@somewhere.net> Description: More about what it does (maybe more than one line) License: What license is it under? Imports: treemap Collate: 'maketree.R'
R /文件夹里面是一个名为’maketree.R’的R文件.其内容是:
#' maketree #' #' @importFrom treemap tmPlot #' @export maketree maketree <- function(data,index,vSize){ tmPlot(data,index=index,vSize=vSize) }
假设您位于’anRpackage’上方的目录中,请运行以下脚本:
library(roxygen2) roxygenise("anRpackage/") library(devtools) build("anRpackage") install("anRpackage")
重新启动R(最好使用–vanilla)并运行以下命令:
library(anRpackage) data(mtcars) maketree(mtcars,"cyl","mpg")
你应该在开始时得到我描述的错误.为什么会这样? RColorBrewer列为树形图的Depends,因此应该自动导入,如果不是?
问题实际上是树形图. treemap使用brewer.pal,因此应该导入:RColorBrewer和importFrom(RColorBrewer,brewer.pal).
现在看来,如果用户说库(树图),树图和RColorBrewer附加到search()路径,并且当评估tmPlot时,在搜索路径上找到brewer.pal,则一切正常.当然,如果用户说brewer.pal =“酵母”或其他东西,那么包装会破裂,因为会找到错误的符号;这是名称空间的原因之一,用于保护树形图的功能不受用户可能执行的操作.
但是当你(正确地)进口时会发生什么:树形图? treemap被加载(到内存中)但是树形图及其依赖项都没有附加(到搜索路径).所以找不到brewer.pal.
如果树图是Imports:RColorBrewer,那么当树图通过调用库(treemap)附加到搜索路径时,以及仅导入到包中时,都会找到brewer.pal.
联系treemap的维护者,让他们更仔细地构建他们的名字空间.