所以我有一个小插图,小插曲/ test-vignette3.Rmd：
---
title: "Sample Document"
output:
html_document:
highlight: kate
theme: spacelab
toc: yes
pdf_document:
toc: yes
---
Header
=========
当我点击针织HTML按钮时,我得到以下内容：
processing file: test-vignette3.Rmd output file: test-vignette3.knit.md Output created: /tmp/RtmpKVpegL/preview-5ef42271c0d5.dir/test-vignette3.html
但是,如果我将此文件复制到inst / doc并点击编织HTML按钮,我会得到：
processing file: test-vignette3.Rmd output file: test-vignette3.knit.md Output created: test-vignette3.html
我的问题是：
>如何让RStudio将vignet / test-vignette3.Rmw上的编织HTML输出保存到vignettes目录？
>如何在编织HTML过程中让RStudio不删除test-vignette3.knit.md？ (我想要.md所以人们可以在我的github回购中阅读.)
我正在运行RStudio版本0.98.836,rmarkdown版本0.1.98和knitr版本1.5.
解决方法
实际上你不应该将.html输出保存在vignettes /下,因为插图输出应该由R CMD构建生成.如果在构建源包时HTML输出文件已经存在,R可能无法重新编译您的插图,这意味着您可能会看到旧的(可能是错误的)结果,因为HTML文件不是从最新版本的.Rmd文件.因此,RStudio有意避免在vignetttes目录中编写HTML文件.
如果您选择忽略上面的警告,您当然可以在R控制台中运行rmarkdown :: render(‘your-vignette.Rmd’).
对于第二个问题,我也不建议你这样做,因为Github以不同的方式呈现降价格式(与通过rmarkdown软件包完成的Pandoc转换相比).通常,包装晕影显示在CRAN上,例如,参见CRAN上的the knitr page.但是,因为rmarkdown软件包尚未在CRAN上,你现在不能使用晕图引擎knitr :: rmarkdown(我想我们现在距离CRAN版本不太远).但是,您可以考虑将HTML文件推送到Github页面.
