使用R在对数刻度上转换变量密度

前端之家收集整理的这篇文章主要介绍了使用R在对数刻度上转换变量密度前端之家小编觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
我想绘制变量的密度,其范围如下:
Min.   :-1214813.0  
 1st Qu.:       1.0  
 Median :      40.0  
 Mean   :     303.2  
 3rd Qu.:     166.0  
 Max.   : 1623990.0

密度的线性图导致在[0,1000]范围内的高柱,具有朝向正无穷大和负无穷大的两个非常长的尾部.
因此,我想将变量转换为对数刻度,以便我可以看到平均值周围发生了什么.
例如,我想的是:

log_values = c( -log10(-values[values<0]),log10(values[values>0]))

这导致:

Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
-6.085   0.699   1.708   1.286   2.272   6.211

这个问题的主要问题是它不包含0值.
当然,我可以使用值[值> = 0] 1将所有值从0移开,但这会在数据中引入一些失真.

将这个变量转换为对数尺度的可接受且科学可靠的方法是什么?

解决方法

除了转换之外,您还可以操纵直方图本身来了解您的数据.这为您提供了这样的优势:图表本身可以读取,您可以立即了解中心的分布情况.假设我们模拟以下数据:
Data <- c(rnorm(1000,5,10),sample(-10000:10000,10))
> summary(Data)
     Min.   1st Qu.    Median      Mean   3rd Qu.      Max. 
-9669.000    -2.119     5.332    85.430    12.460  9870.000

然后你有几种不同的方法.最容易看到数据中心的内容,只是绘制数据的中心.在这种情况下,假设我对第一个和第三个四分位数之间发生的事情感兴趣,我可以绘制:

hist(Data,xlim=c(-30,30),breaks=c(min(Data),seq(-30,30,by=5),max(Data))
     main="Center of Data"
     )

如果您还想计算尾部,您可以转换数据以折叠尾部并更改轴以反映它,如下所示:

>您将感兴趣范围之外的所有值分配到该范围之外的值
>绘制直方图,将一个箱中的所有极值合并
>使用正确的标签构造X轴
>您使用包plotrix中的axis.break()在X轴上添加一些断点,表示不连续的轴

为此你可以使用类似下面的代码

require(plotrix)
 # rearrange data
 plotdata <- Data
 id <- plotdata < -30 | plotdata > 30
 plotdata[id] <- sign(plotdata[id])*35
 # plot histogram
 hist(plotdata,xlim=c(-40,40),breaks=c(-40,main="Untailed Data",xaxt='n'   # leave the X axis away
      )
 # Construct the X axis
 axis(1,at=c(-40,by=10),labels=c(min(Data),max(Data))
 )
 # add axis breaks
 axis.break(axis=1,breakpos=-35)
 axis.break(axis=1,breakpos=35)

这给你:

请注意,通过向hist()函数添加freq = TRUE可以获得原始频率.

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