r – 具有多个输入和输出的Makefile

前端之家收集整理的这篇文章主要介绍了r – 具有多个输入和输出的Makefile前端之家小编觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
我想使用makefile来更新R代码生成的图形文件. R代码在目录../R中的各种文件中,所有文件以.R结尾.图形文件位于目录../figs中,全部以.pdf或.png结尾.如果R文件的日期比任何图形文件更晚,我想使用该命令处理R文件
R --no-save < file.R

我已经看了一个各种示例makefile,但找不到任何可以适应的东西.

我目前的努力(不工作)如下:

PLOTDIR= ../figs
RDIR= ../R
RFILES= $(RDIR)/*.R
PLOTS= *.pdf *.png
FIGURES= $(PLOTDIR)/$(PLOTS)
$(FIGURES): $(RFILES)
    R --no-save < $<

解决方法

你可以尝试以下几点.

诀窍是你需要从输入(.R文件)推导出输出

# Makefile
# Beware of indentation when copying use TABS

PLOTDIR = ../figs
RDIR = ../R

# list R files
RFILES = $(wildcard $(RDIR)/*.R)

# compute output file names
PDF_FIGS = $(RFILES:.R=.pdf)
PNG_FIGS = $(RFILES:.R=.png)

# relocate files in output folder
OUT_FILES = $(subst $(RDIR),$(PLOTDIR),$(PDF_FIGS) $(PNG_FIGS))

# first target is the default: simply do 'make'
all: $(OUT_FILES)

clean:
    rm $(OUT_FILES)

.PHONY: all clean

# need to split PNG from PDF rules
$(PLOTDIR)/%.png: $(RDIR)/%.R
    R --no-save < $<

$(PLOTDIR)/%.pdf $(PLOTDIR)/%.png: $(RDIR)/%.R
    R --no-save < $<

编辑以反映我的评论:每个R脚本使用1个依赖输出文件

PLOTDIR= ../figs
RDIR= ../R

# list R files
RFILES := $(wildcard $(RDIR)/*.R)

# relocate files in output folder
OUT_FILES=$(subst $(RDIR),$(RFILES:.R=.out))
#$(warning $(OUT_FILES))

# first target is the default: simply do 'make'
all: $(OUT_FILES)

clean:
    rm $(OUT_FILES)

.PHONY: all clean

$(PLOTDIR)/%.out: $(RDIR)/%.R
    R --no-save < $< && touch $@

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