<ul ng-repeat="arr1 in arrays01">
    <ui ng-repeat="arr2 in arrays02">
      <li ng-bind="'day:' + days[$parent.$index][$index] + ' flag:' + flags[$parent.$index][$index]"></li>
    </ul>
  </ul>

代码中的$parent.$index代表第一层循环的index值，[$index]代表第二层循环的index