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文本处理前：

data1.txt：
range1:1-6
range1:7-14
range1:15-18
range1:19-23
range2:2-7
range2:8-11
range2:12-16
range2:18-20

data2.txt：
range1:2-4
range1:6-9
range1:10-17
range2:1-6
range2:7-12
range2:13-14
range2:17-19

定义：

差异区域：如果两个集合的交集范围小于等于2，就认为是差异区域。如果两个集合是父子集的关系，不管它们的交集范围是多少，都不算差异区域。

目标：

根据这2个文件生成3个文件，分别是data1_diff.txt、data2_diff.txt和data_comm.txt。

data1_diff.txt用于存放data1.txt与data2.txt的差异区域。

data2_diff.txt用于存放data2.txt与data1.txt的差异区域。

data_comm.txt用于存放非差异区域。

文本处理后：

data1_diff.txt：
range1:15-18
range1:19-23
range2:18-20

data2_diff.txt：
range1:6-9
range2:17-19

data_comm.txt:
range1:1-6  2-4
range1:7-14  10-17
range2:2-7  1-6
range2:8-11  7-12
range2:12-16  13-14

我的脚本：

#!/usr/bin/perl
use warnings;
use strict;
use 5.010;

sub JiaoJi {
        return 2 if $_[0][0] <= $_[1][0] && $_[0][1] >= $_[1][1] || $_[0][0] >= $_[1][0] && $_[0][1] <= $_[1][1];
        return ($_[0][1] - $_[1][0] > 2) ? 2 : 0 if $_[0][0] <= $_[1][0] && $_[0][1] <= $_[1][1];
        return ($_[1][1] - $_[0][0] > 2) ? 2 : 1 if $_[0][0] >= $_[1][0] && $_[0][1] >= $_[1][1];
}

open(FILE1, 'data1.txt') or die;
open(FILE2, 'data2.txt') or die;

my(%hash1, %hash2);

while(<FILE1>){
        chomp;
        @_ = split /[:-]/;
        push(@{$hash1{$_[0]}}, [$_[1], $_[2]]);
}

while(<FILE2>){
        chomp;
        @_ = split /[:-]/;
        push(@{$hash2{$_[0]}}, $_[2]]);
}

close(FILE1);
close(FILE2);

for my $key (keys %hash1){
        while(@{$hash1{$key}}){
                while(@{$hash2{$key}}){
                        unless(@{$hash1{$key}}){
                                open(OUTPUT_FILE, '>>data2_diff.txt');
                                printf OUTPUT_FILE "%s:%d-%d\n", $key, $_->[0], $_->[1] for @{$hash2{$key}};
                                undef @{$hash2{$key}};
                                close(OUTPUT_FILE);
                                last;
                        }
                        given(JiaoJi($hash1{$key}[0], $hash2{$key}[0])){
                                when(0){
                                        open(OUTPUT_FILE, '>>data1_diff.txt');
                                        say OUTPUT_FILE "$key:$hash1{$key}[0][0]-$hash1{$key}[0][1]";
                                        shift @{$hash1{$key}};
                                }
                                when(1){
                                        open(OUTPUT_FILE, '>>data2_diff.txt');
                                        say OUTPUT_FILE "$key:$hash2{$key}[0][0]-$hash2{$key}[0][1]";
                                        shift @{$hash2{$key}};
                                }
                                when(2){
                                        open(OUTPUT_FILE, '>>data_comm.txt');
                                        say OUTPUT_FILE "$key:$hash1{$key}[0][0]-$hash1{$key}[0][1] $hash2{$key}[0][0]-$hash2{$key}[0][1]";
                                        shift @{$hash1{$key}};
                                        shift @{$hash2{$key}};
                                }
                        }
                        close(OUTPUT_FILE);
                }
                open(OUTPUT_FILE, '>>data1_diff.txt');
                printf OUTPUT_FILE "%s:%d-%d\n", $_->[1] for @{$hash1{$key}};
                undef @{$hash1{$key}};
                close(OUTPUT_FILE);
        }
}